Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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