Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DffaO54786 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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DffaO54786 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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DffaO54786 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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DffaO54786 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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DffaO54786 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DffaO54786 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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DffaO54786 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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DffaO54786 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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DffaO54786 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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