Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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