Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timm44O35857 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms