Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kpna3O35344 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms