Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 576 ms