Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-Q1O19441 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-Q1O19441 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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