Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GclmO09172 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GclmO09172 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GclmO09172 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GclmO09172 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GclmO09172 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GclmO09172 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms