Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casq1O09165 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Casq1O09165 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Casq1O09165 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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