Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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