Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms