Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20878L7N244 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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