Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8356J3QPD3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms