Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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