Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms