Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arid4aF8VPQ2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms