Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms