Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms