Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8247F6VRJ8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms