Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmod3E9QA62 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmod3E9QA62 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmod3E9QA62 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmod3E9QA62 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmod3E9QA62 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmod3E9QA62 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmod3E9QA62 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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