Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh16f1E9Q9P8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rdh16f1E9Q9P8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms