Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms