Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms