Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms