Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tgfbr3lD3YZZ2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tgfbr3lD3YZZ2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tgfbr3lD3YZZ2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tgfbr3lD3YZZ2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tgfbr3lD3YZZ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgfbr3lD3YZZ2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms