Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc6D3YZP9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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