Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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PtprbB2RU80 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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PtprbB2RU80 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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PtprbB2RU80 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms