Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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