Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms