Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms