Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms