Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms