Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm6880A3KG45 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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