Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf39A2RT81 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms