Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms