Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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