Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Kiaa1109A2AAE1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Kiaa1109A2AAE1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms