Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms