Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms