Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vamp5Q9Z2P8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms