Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms