Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms