Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms