Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms