Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms