Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme4Q9WV84 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms