Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms