Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tnnt3Q9QZ47 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tnnt3Q9QZ47 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tnnt3Q9QZ47 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tnnt3Q9QZ47 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tnnt3Q9QZ47 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnt3Q9QZ47 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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