Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abt1Q9QYL7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abt1Q9QYL7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms