Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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